Copiar o Eclipse do Ubuntu 11 e usar no Ubuntu 12

Após copiar o Eclipse Indigo do Ubuntu 11.10 e colocar no Ubuntu 12.04, ao tentar executar, se o sistema não permitir executar o Eclipse, o problema poderá estar na permissão.

Clique com o botão direito no eclipse >> propriedades.
Na aba "Permissões" check o campo "Permitir execução do arquivo como um programa" e feche.

Pronto, agora poderá executar o eclipse.